至此，自1952年院系調整以來(lái)所形成的四校分治的局面結束了。浙江大學(xué)由此停止了對蘇聯(lián)模式的使用，恢復了1952年之前的學(xué)科設置，重新成為了綜合性大學(xué)。

　　1999年，浙江大學(xué)成為首批9所列入國家“985工程”建設計劃的全國重點(diǎn)大學(xué)之一。

　　2007年1月21日，浙江大學(xué)恢復了1952年院系調整時(shí)停辦的航空航天系，該系隸屬于新成立的航空航天學(xué)院。

　　2009年上半年，浙江大學(xué)實(shí)行了學(xué)部制，全校調整為七大學(xué)部——人文學(xué)部、社會(huì )科學(xué)學(xué)部、理學(xué)部、工學(xué)部、信息學(xué)部、農業(yè)生命環(huán)境學(xué)部、醫藥學(xué)部。10月9日，中國的九校聯(lián)盟（C9）啟動(dòng)，浙江大學(xué)成為聯(lián)盟成員之一。

　　2012年6月10日，浙江大學(xué)成立了海洋學(xué)院，學(xué)院由海洋科學(xué)系、海洋工程學(xué)系、海洋信息學(xué)系和海洋經(jīng)濟管理系組成，隸屬于工學(xué)部，位于浙大新成立的舟山校區。

　　2013年5月15日，浙江大學(xué)與英國帝國理工學(xué)院就建立聯(lián)合學(xué)院事宜簽署了“浙江大學(xué)——帝國理工聯(lián)合學(xué)院合作諒解備忘錄”，浙江大學(xué)成為中國首個(gè)在世界名校建立海外校區的高校。

　　2017年9月，浙江大學(xué)入選國家“雙一流”A類(lèi)（世界一流大學(xué)和一流學(xué)科）建設高校。