學(xué)校始建于1951年，前身是西南區川南醫士學(xué)校，1959年升格為瀘州醫學(xué)專(zhuān)科學(xué)校，1978年升格為本科院校并更名為瀘州醫學(xué)院，1982年獲得學(xué)士學(xué)位授予權，1993年成為碩士學(xué)位授予單位，2001年開(kāi)始聯(lián)合培養博士，2004年起開(kāi)展留學(xué)本科生學(xué)歷教育，2010年獲準設立博士后科研工作站，2015年更名為西南醫科大學(xué)。學(xué)校是推薦優(yōu)秀應屆本科畢業(yè)生免試攻讀碩士研究生資格單位，是四川省依法治校示范學(xué)校、四川省文明校園、四川省高等學(xué)校教育信息化示范學(xué)校。2014年被列入四川省新增博士學(xué)位授予單位立項建設規劃，2016年被列入立項建設單位。