入選國家“中西部高�；A能力建設工程”、“卓越醫生教育培養計劃”、“卓越農林人才教育培養計劃”、“服務(wù)國家特殊需求博士人才培養項目”、“湖南省2011計劃”，為中國服務(wù)外包校企聯(lián)盟成員單位。
吉首大學(xué)成立于1958年4月，1978年復升為省屬綜合性大學(xué)，同年中南大學(xué)湘雅醫學(xué)院湘西分院并入吉首大學(xué)組建醫療系，湘潭大學(xué)湘西分校并入吉首大學(xué)組建體育系，2000年，吉首衛生學(xué)校并入吉首大學(xué)；2001年，湘西民族教育學(xué)院與吉首民族師范學(xué)校并入吉首大學(xué)組建吉首大學(xué)師范學(xué)院；2002年，武陵高等專(zhuān)科學(xué)校（武陵大學(xué)）并入吉首大學(xué)成為吉首大學(xué)張家界校區。