一、概念上的區別。 消毒指對病原微生物的繁殖體的致死作用，但不能殺死芽孢等全部微生物，因此消毒是不徹底的，不能代替滅菌。凡用于消毒的化學(xué)藥品稱(chēng)為消毒劑，因此常稱(chēng)消毒劑為化學(xué)消毒劑。 滅菌殺滅物體中所有活的微生物（含芽孢）的作用，滅菌是采用強烈的理化因素使任何物體內外部的一切微生物永遠喪失其生長(cháng)繁殖能力的措施。通常用物理方法來(lái)達到滅菌的目的。

　　二、處理方法的區別。 滅菌與消毒相比，要求更高，處理更難。滅菌必須選用能殺滅抵抗力最強的微生物（細菌芽孢）的物理方法或化學(xué)滅菌劑。而消毒只需選用具有一定殺菌效力的物理方法、化學(xué)消毒劑或生物消毒劑。 將滅菌的處理方法用于消毒完全沒(méi)有必要，而且還會(huì )產(chǎn)生本來(lái)可以不發(fā)生的副作用；而如果將消毒的處理方法用于滅菌,將會(huì )導致滅菌失敗。

　　三、應用上的區別。 滅菌主要用于處理醫院中進(jìn)入人體無(wú)菌組織器官的診療用品和需要滅菌的工業(yè)產(chǎn)品，消毒用于處理日常生活和工作場(chǎng)所的物品,也用于醫院中一般場(chǎng)所與物品的處理.