學(xué)校創(chuàng )建于1934年,時(shí)名江蘇省立醫政學(xué)院。1957年,由鎮江遷至南京,更名為南京醫學(xué)院。1962年,被列為全國首批六年制醫藥院校。1981年,被批準為全國首批博士、碩士學(xué)位授予單位。1993年,更名為南京醫科大學(xué)。
學(xué)校建有江寧校區、五臺校區以及康達學(xué)院連云港校區;設有19個(gè)學(xué)院(包含康達學(xué)院),開(kāi)設25個(gè)本科專(zhuān)業(yè);擁有25所附屬醫院和50多所教學(xué)醫院;擁有一級學(xué)科博士點(diǎn)8個(gè)、二級學(xué)科博士點(diǎn)54個(gè)、4個(gè)交叉學(xué)科博士點(diǎn);一級學(xué)科碩士點(diǎn)11個(gè);博士后科研流動(dòng)站6個(gè);有在職教職工1800多人,學(xué)生總數為1.8萬(wàn)多人。