入選國家“中西部高�；A能力建設工程”、安徽省第一批地方特色高水平大學(xué)和第一批綜合改革試點(diǎn)學(xué)校、國家“特色重點(diǎn)學(xué)科項目”建設高校、國家建設高水平大學(xué)公派研究生項目、國家級大學(xué)生創(chuàng )新創(chuàng )業(yè)訓練計劃、國家藥品臨床研究基地、中國政府獎學(xué)金來(lái)華留學(xué)生接收院校、教育部“卓越醫生教育培養計劃”試點(diǎn)高校，長(cháng)三角醫學(xué)教育聯(lián)盟創(chuàng )始成員。
學(xué)校前身是1926年5月創(chuàng )辦的上海東南醫學(xué)院。1949年底，響應中共中央華東局“面向農村，走向內地”的號召，東南醫學(xué)院內遷安徽省，成為安徽省第一所高等醫科院校。1952年改名為安徽醫學(xué)院。1985年更名安徽醫科大學(xué)。